Temiz oda kullanımının en elzem olduğu alanlardan birinin ilaç sektörü olduğunu söyleyebiliriz. Ancak ilaç sektörünün demirbaşı olan temiz odaların, tasarım hataları nedeniyle pek çok soruna yol açabileceği unutulmamalıdır. Bu nedenle öncelikle ilaç sektöründeki temiz oda tasarımında dikkat edilmesi gerekenlerin tüm teknik detaylarıyla bilinmesi gerekir.
İlaç sektöründe temiz oda tasarımında ortaya çıkan sorunlara yol açan en önemli etken üreticinin ihtiyaçlarının tam olarak dikkate alınmamasıdır. Üreticinin ihtiyaçları tam anlaşılmaz, gereken özellikler tespit edilmezse, doğru tasarlanmış temiz odaların inşası da mümkün olmayacaktır.
Üreticinin ihtiyaçlarını anlamak için ne üreteceğini bilmek ve bu ürünün tasarıma olan etkisini, iç hava kalitesinin bu üretimdeki yerini hesaba katmak gerekir. Üretilen ilaçların temiz oda tasarımına etkisi, odanın yerleşim planının ve iç mekan gereksinimlerinin farklılığı üzerinden açıklanabilir. İlaç üretiminde ürünler üç gruba ayrılır: enjeksiyonlar, yüzeysel uygulamalar ve oral uygulamalar. Enjekte edilebilenler, sıvı hazırlananlar, dondurarak kurutma ve toz dolum işlemlerinden geçenler, dışarıdan uygulananlar ve ağızdan alınanlar… Tüm bu ilaçlar için tasarlanacak temiz odalar belli noktalarda birbirinden farklı olmak durumundadır. Örneğin enjeksiyonlar, yüzeysel ve oral uygulanan ilaçlara göre çok daha iyi iç hava kalitesine ihtiyaç duyar. Enjeksiyon üreten bir firma için tasarlanacak temiz odanın da bu farklılıklar dikkate alınarak yapılması gerekmektedir.
Tasarım sürecinde, Federal Standart 209 ve çeşitli ulusal GMP’ler gibi standartların kullanılıp kullanılmadığı ve temiz oda yerleşim planı dikkatle göz önüne alınmalıdır. İç hava kalitesinde olması gereken parametreler; havalandırma kriterleri, oda basınçlandırması, açık kapı ve kapalı kapı çözümleri, hava debisi hesaplama teknikleri, sıcaklık farklılıklarının etkisi, personel, proses ekipmanı ve yüzeylerden kaynaklanan kirlenmeler, arızalı HEPA’dan kaynaklanan kirlenmeler, filtre sistemleri ve temizleme yöntemleri, kullanılan hava besleme difüzörleri ve menfezleri, personel, ekipman ve yüzeylerden kaynaklanan kirliliktir.